網站名稱 網站簡介
BLAST
BLAST為在NCBI網佔所提供資料庫搜尋的工具,主要在做序列的比對。
除提供多資料庫快速查詢功能外亦同時提供數種重要統計方法供研究使用。
The NCBI PubMed PubMed是美國國家醫學圖書館提供使用者免費檢索的電子資料庫,可以免費查詢文獻 摘要。檢索結果若有全文,則可直接連結到出版社的網站,大部份皆必須付費訂購全文。
ExPASy 蛋白質資料庫 -- ExPASy Molecular Biology Server
ExPASy為全世界最重要的蛋白質資料庫,目前為GCG最主要的蛋白質資料來源。
主要內容包括蛋白質序列、構造的多個重要資料庫以及收集蛋白質序列和構造的分析工具。
The Genome Database(GDB)基因體資料庫鏡相站 GDB是人類的Genome資料庫,主要存放人類基因體的資料,收錄了人類基因體所有的圖譜資訊。
The NCBI Entrez Taxonomy Homepage
將已知的含有核甘酸和蛋白質的有機體按分類法排好,可以選擇想看的分支之後再加以觀看。
Fly Base 這是一個介紹有關目前對果蠅研究的網站,包含果蠅的DNA序列,一些reference到果蠅的Paper。
EMBL(European Bioinformatics Institute) 一個搜尋nucleotide sequces,Protein sequence,Protien structure 的網站。
NCBI Entrez Entrez是NCBI成立的一個生化綜合搜尋系統,主要是聯結了很多相關資料庫,可查得相關論文、 DNA序列、蛋白質、三級結構、染色體、物種分類、基因表現等資訊。
MAP - Multiple Global Alignment of Sequences Using Iterative Pairwise Method 提供DNA序列比對的網站,依照其規定的型式輸入即可,有許多使用上貼心的服務,且可挑選自已喜歡的比對方法。
The NCBI OMIMTM - Online Mendelian Inheritance in ManTM 「人類線上的孟德爾」,顧名思義,他匯整了人類從以前到現在的基因相關資訊,可能來自沒分類或不知名作者的寶貴資訊或文章,可用關鍵字搜尋。
NCBI GenBank NCBI的GenBank是一個主要的基因資料庫, 它資料其中一個重要來源就是研究者直接提交的新資料.
提交的方法有用E-mail傳, 用磁片寄和用其專用軟體如BankIt和Sequin直接透過網 路上傳.

EBI ClustalW
ClustalW是一種用來作Multi Sequences Alignment的演算法.
這個網頁是European Bioinformatics Institute以WWW介面提供人使用的.
以下網址有提供平行計算ClustalW可以在自家的工作站上用
http://www.sgi.com/solutions/sciences/chembio/resources/clustalw/parallel_clustalw.html

Bowie

BioWeb是一個由University of Wisconsin System下14個不同的大學和研究中心共
同合作建構的網站.
其收集了許多資源, 有提供許多生物資訊的介紹性的資料等.

榮陽 數位化醫學辭典----線上查詢 可以查詢一些醫學生物的專有名詞。

 

網站名稱 網站簡介 更新日期
BioPhyTalk 利用類似投影片的方式,介紹如何解決Protein folding的問題,裡面的圖皆是彩圖,若想了解Protein Sequences 是做什麼,可以來這站看看 。  
Computational Biology Page 裡面連結了許多研究 Protein 的patterns 以及 其functions的Research Centers 和 一些學校有關於Computational Biology 的課程。  
Mouse Genome Informatics (MGI) 老鼠生物資訊資料庫鏡相站    
Protein Data Bank(PDB) 蛋白質結構資料庫鏡相站    
The Genome Database(GDB) 基因體資料庫鏡相站    
MIT Biology Hypertextbook 很不錯的on-line生物學  
The International Society for Computational Biology The International Society for Computational Biology    
Bioinformatics and Computational Biology-Related Journals BioInformatic and Computational Biology相關的出版刊物可供查詢,已做好適當的分類。  
Physical mapping Physical mapping of the genome的相關技術文件及介紹  
National Center for Biotechnology Information (NCBI, NLM, NIH) 全世界序列資料的整合中心  
European Bioinformatics Institute (EBI) 這是歐洲的NCBI   
DNA Data Bank of Japan (DDBJ)

這是日本的DDBJ
(NCBI, EBI 及 DDBJ是目前生物序列的三大集散中心, 它們互相傳遞資料)

  
National center for biotechnology information(NCBI) 生物科技資訊的世界中心,一個非常強大的網站,包含了所有的相關資料庫及有用的資料擷取技術,是學生物相關不可或缺的網站,其中功能可在其他連結上找到相關介紹。  
Projects in Computational Biology and Bioinformatics 一個研究如何將巨大的生物資訊整合、實做、利用,如蛋白質功能的鑑定、DNA特殊序列或功能性序列的發現、植物基因與疾病的分析和合成基因序列的啟動子,的一個研究型網站。    
Human Genome Project Information 一個鑑定基因、找出有用的DNA片斷,將其保留在資料庫堙A並改進資料分析的工具的研究型網站。  
行政院國家科學委員會生科發展處 有關生物、生命、醫、農的相關作業及報導,較偏向生命科學與人類生活進步的成果與推動。  
The Molecular Biology Database Collection-2003 update (PDF檔)  收集許多與生物資訊相關網站的一篇paper,每年皆會更新內容。  
生物資訊演算法群體學習網站 這是一個群體學習生物資訊的E-learning 網站,網站內容分成生物學知識、演算法及生物資訊三部分,做詳細的分類及解說。  
SDAP
SDAP整合多個與allergen(過敏原) protein相關資料庫及其相關工具軟體.
整合資料庫範圍包括Swissprot, PIR, NCBI, PDB
2003/09/20
Protein Interaction Databases 此網站是一個Protein Interaction Database的collection 2004/01/01
Yalin's 生物超連結 可查生物及醫學名詞的網站 2004/01/16
www.bioalgorithms.info It is the website of book "An Introduction to Bioinformatics Algorithms" written by Neil C. Jones and Pavel A. Pevzner.
There are some resources about the book such as the Powerpoint slides, the practical or implementation problems, and useful links.
2004/12/06
juang.bst.ntu.edu.tw/ECX/Ana5.htm 蛋白質構造與組成分析 2004/12/15

更新:2004/12/15