3/30-4/4 TOP

日期內容備註

3/30-4/4 1.寫計算機結構，以及準備兩個星期後的期中考。

2.學習C++中。

3.準備有關以後論文研究方向。

3/23-3/29 TOP

日期內容備註

3/23-3/29 1.看paper: Genome Rearrangement with Gene Family

David Sankoff, Bioinformatics, Vol. 15,No. 11 pp.909-917, 1999

2.學習C++中。

3.有空就看Sheldon Ross的A First Course in Probability。

3/16-3/22 TOP

日期內容備註

3/16-3/22 1.研讀計算機結構chap.1以準備小考

2.學習C++中。

3.有空就看Udi Manber的Introduction to Algorithms: A Creative Approach。

3/11-3/17 TOP

日期內容備註

3/11-3/17 1.研讀計算機結構chap.1

2.學習C++中。

3.研讀paper：Parametric Genome Rearrangement, by Mathieu Blanchette,

Takashi Kunisawa, David Sankoff, Gene-Combis, Gene 172, pp.11-17, 1996

3/4-3/10 TOP

日期內容備註

3/4-3/10 1.研讀有關Genome rearrangement的資料。

2.學習C++中。

3.研讀paper：Parametric Genome Rearrangement, by Mathieu Blanchette,

Takashi Kunisawa, David Sankoff, Gene-Combis, Gene 172, pp.11-17, 1996

2/25-3/3 TOP

日期內容備註

2/25-3/3 1.研讀有關Genome rearrangement的資料。

2.學習C++中。

3.學習Linux的基本觀念。

1/14-1/20 TOP

日期內容備註

1/14-1/20 1.準備網路安全期末考。

2.寫演算法作業第十一章。

3.讀paper：Sorting by Transpositions, by Vineet Bafna, and Pavel A. Pevzner,

Siam J. Discrete Math. Vol. 11, No. 2, pp 224-240, May, 1998

1/7-1/13 TOP

日期內容備註

1/7-1/13 1.研讀TCP/IP Illustrated vol.1以準備期末考。

2.讀演算法第十章以及寫作業。

3.準備演算法期末考。

4.準備寫高等電腦網路作業7。

12/31-1/6 TOP

日期內容備註

12/31-1/6 1.研讀TCP/IP Illustrated vol.1以準備期末考。

2.讀演算法第十章以及寫作業。

3.讀paper：Steiner points in the space of genome rearrangements

by David Sankoff, Gopalakrishnan Sundaram, John Kececioglu,

May 8, 1995; revised Jan. 17, 1996

4.有空便學C++及研讀Introduction to Computational Biology。

12/24-12/30 TOP

日期內容備註

12/24-12/30 1.研讀TCP/IP Illustrated vol.1以準備期末考。

2.讀演算法八、九章以及寫作業。

3.讀paper：Steiner points in the space of genome rearrangements

by David Sankoff, Gopalakrishnan Sundaram, John Kececioglu,

May 8, 1995; revised Jan. 17, 1996

4.準備寫高等網路最後一個作業的前置工作。

12/17-12/23 TOP

日期內容備註

12/17-12/23 1.寫高等網路作業。

2.準備paper的補充範例。

3.寫演算法第七章作業。

4.撰寫演算法project程式跟報告。

5.有空就唸一下生物資訊的書。

12/10-12/16 TOP

日期內容備註

12/10-12/16 1.準備網路安全期中考。

2.準備報PAPER。

3.唸演算法第七章以準備寫作業。

4.參加在高醫大舉辦的生物資訊研習會。

5.有空就讀TCP/IP的書跟計算生物學的書。

12/4-12/9 TOP

日期內容備註

12/4-12/9 1.撰寫term project，總算在初步demo前趕了出來，真的蠻累的。

雖然通過了demo，但是兩個星期後還有正式報告，還是要快點寫。

2.唸演算法第六章以準備寫作業。

3.研讀paper：A Greedy Algorithm for Aligning DNA Sequences

(Journal of Computational Biology,Vol.7,Number1/2, pp.203-214, 2000)。

4.有空就讀TCP/IP的書跟計算生物學的書。

11/26-12/3 TOP

日期內容備註

11/26-12/3 1.研讀欲作為演算法Term Project的paper，但是發現很難將之實作出來，不過在尋找相關資料的過程中

，發現了另一個與該主題相關的演算法：Smith Waterman Algorithm，較原先題目易實作且兼具一定難度

所以跟老師報備後決定更改題目為此演算法。

2.寫演算法作業第五章。

3.準備網路安全期中考。

4.尋找下一篇paper以準備兩個星期後的報告。